1947年，日本遗属会成立，要求政府操办阵亡者在靖国神社的合祀，并对遗属进行补偿。1956年以后，由于厚生省的协助和因公补偿法的实施，导致靖国神社和国家（日本政府）之间再次产生联系。
日本在1952年的旧金山条约中接受了国际社会的东京审判等一系列战犯审判，脱离美军占领，恢复独立，重返国际社会。但在该和平条约生效后的三天，日本政府在对日本国内阵亡者遗属的态度上，发布法务总裁令，宣布战犯在国内不是犯罪者。这种对内对外的双重标准是日本政府应对战争受刑援助会等日本军国主义遗属们的开始，随后遗族援护法等被从法律层面修改，免于死刑的日本战犯被释放，靖国神社的战犯合祭问题变得合法化。把靖国神社再次纳入国家管理的国家护持法在日本自民党的提议下，遭到了日本在野党和参议院的强烈反对，没有通过，从此再未被提交国会，但这却排除了A级战犯合祀的障碍。1978年10月，A级战犯在靖国神社以“昭和殉难者”的名义合祀，14名A级战犯被靖国神社列为英灵。日本政府在这个问题上对二百万阵亡者的遗属和援助会、战友会等有了个“交代”。日本中曾根康弘首相是历代首相中第一次公开参拜靖国神社的首相，从此，靖国神社问题被升级到国际外交层面，中韩等曾经在二战中受到日本军国主义侵略的国家提出强烈反对，这个矛盾一直未被解决直至今天。日本对国际社会和对国内在这个问题上是两种截然相反的态度，这才是问题的关键。
