靖国神社共祭奠着两百四十六万死于战争的日本人。联合国军总司令部（GHQ）曾认为靖国神社助长了战前日本的军国主义，打算将其废除。
美国认为日本的靖国神社并非宗教，而是崇尚日本军国主义的英雄，培育具有攻击性的国家主义精神的场所。这对太平洋地区的和平有现实威胁。
在日本人眼里，战死后被祭祀在靖国神社是日本人的最高荣誉，即便是天皇，也要向死难者低头。这就是二战中日本人宁死不降的原因，比如神风敢死队等。
靖国神社是明治天皇授意建造，目的是为了祭奠为国捐躯者表彰他们的功绩，属陆军省和海军省共同管辖。日本战败被美国接管后，陆、海军被撤即被提上日程。但陆军省却试图在这时候举行靖国神社的大祭。陆军省美山上校与东条英机偷偷会面，东条英机认为靖国神社意义重大，是日本国体——皇室及其精神的体现，剖腹者也应该被收入靖国神社祭祀。美军索普少将反对日本陆军省准备加快临时举行的大招魂祭。但最后日本天皇和陆、海军大臣及各级官员及部队代表还是身着西服参拜，靖国神社的祭祀者从三十多万增加至二百多万。随后日本陆、海军省被裁撤，麦克阿瑟着手制定废除日本国家神道的政策。
日本人后来想出法子，把靖国神社改为宗教场所，而美国并不反对宗教自由，因此逃过了被废掉的下场。靖国神社变成宗教法人以后，开始谋求存续之法。昭和天皇被禁止参加合祀，GHQ想要把日本“去神道化”，到了昭和25年，冷战升级，美军在日本的占领也到了最后时间，对日的非军事化政策鉴于日本在冷战期间成为“共产主义的防洪堤”作用发生重大变化。次年，GHQ撤销禁令，靖国神社的得以保留下来，昭和天皇开始参拜靖国神社。
