1978年12月，越南入侵柬埔寨，推翻了持续三年八个月的共产主义波尔布特政权。经历过三十年内战，1993年，在联合国的支持下，柬埔寨新政府成立，洪森任首相。联合国要求柬埔寨新政府对柬埔寨大屠杀进行调查。负责具体实施调查的是柬埔寨文献中心，因新政府缺乏资金支持，欧美人权团体的援助下大约于1995年成立。
该片摄制组2005年采访了波尔布特派二把手的农谢，他不承认有150多万人死于红色高棉的大屠杀。他认为波尔布特派的革命理想是正确的。
1970年，因越南战争中柬埔寨被南越政府和美军认为是越南共产党的大后方，在美国中情局的支持下，成立了朗诺政权。与之对抗的是柬埔寨共产党波尔布特派因为有共产主义阵营提供帮助而羽翼渐丰。波尔布特派的大多数干部在法留学期间接触了马列主义。
与越南共产党不同，柬埔寨共产党是极其激进的，他们全盘否定私有财产和家庭经济，仅仅重视农业生产。
1975年，越南战争结束，共产主义阵营获得胜利，与之伴随的，是柬埔寨的朗诺政权垮台，朗诺被迫亡命美国，波尔布特派赢得胜利。波尔布特派要求居住在金边的二百万居民离开市区，去农村居住。农谢说这是暂时的，但事实上，这些人中没有人能够重返金边。
波尔布特以农业立国，稻田一年两熟，波尔布特就开始学老毛“放卫星”，制定了不切实际的经济发展目标。在这样的政策下，所有的劳力都必须在农田里从事农业生产，夫妻不能团聚。只有革命伴侣家庭出生的孩子，才可以与父母同居。红色高棉设立了合作社，每个劳力一天吃两顿饭，他们认为国民只是生产的元素，家庭组织和家族关系被大规模破坏。他们还设立了互相监视的制度，实行白色恐怖统治，当时的柬埔寨人一听到“温卡”就怕得要命。
柬埔寨的共产主义政权成立没多久，因粮食产量无法达到波尔布特的预期目标，各地开始出现预报产量的情况，合作社里却是颗粒无收。于是红色高棉开始陷入越是加强管理，产量越是降低的恶性循环。人们都说历史的车轮是滚滚向前，但回望历史的细节你会发现，它有时候经常在原地打转，发生在中国大跃进时期的各种奇闻异事，在十多年以后再次按原剧本在柬埔寨上演。
粮食不能增产的原因，波尔布特没有从政权自身找原因，而是企图在国民身上寻找理由，红色高棉为了揪出“潜伏、渗透在党内的间谍和叛徒”，开始在全国进行大清洗（深得斯大林和毛的真传）。他们采取了各种措施对普通国民进行严刑逼供，织罗罪名，并对很多人处以极刑。
1977年，波尔布特政权与越南反目成仇，波尔布特开始要求在东部边境抓越南间谍。终于，部队中有人开始叛乱，叛乱首领韩桑林，后来变成反波尔布特派。后来韩桑林带兵到越南，要求越南提供帮助以推翻波尔布特政权，越南提供武器并对韩桑林部反复训练。
1978年越军和韩桑林部一起入侵柬埔寨，仅仅两个星期就攻陷了首都金边，因为柬埔寨已经没有人愿意维护波尔布特政权了。之前波尔布特到访中国，与华国锋、邓小平等人会面，中国问波尔布特他们能否抵抗住越来越强大的越南，波尔布特说没问题，不需要中国的帮助。
柬埔寨大屠杀中，一百五十多万人被杀，让人们对二战后冷战中持续的共产主义的民族解放理念产生重大疑问。波尔布特倒台后，韩桑林部上台，柬埔寨的内战持续了二十年，直到1991年联合国调停才结束。1998年，波尔布特死于柬埔寨北部山区，农谢等领导人率众投降，与新政府达成了“只要肯合作，既往不咎”的政治交易。
柬埔寨文献中心对大屠杀的调查还在持续。
